办公室（与机关党委合署）
负责文电、会务、机要、档案等机关日常工作；承担信息、安全、保密、信访、政务公开等工作；起草有关地方性法规、规章草案，承担有关行政复议和行政应诉工作；承担继承和发展中医药文化的有关工作；负责机关和指导直属单位的党群、纪检和监察工作。
联系电话：020-83848486
规划财务处（人事处）
拟订中医药事业中长期发展规划；参与制定中药产业发展规划和产业政策；组织开展中药资源的普查，促进中药资源的保护、开发和合理利用；承担重点项目、部门预决算和财务、资产的有关管理工作；组织拟订并实施中医药人才发展规划；会同有关部门拟订中医药专业技术人员资格标准并组织实施；负责机关和指导直属单位的人事管理、机构编制、劳动工资和离退休人员服务工作。
联系电话：020-83848486
医政处
拟订并组织实施中医药防治重大疾病规划，中医、中西医结合、民族医医疗和保健机构及其技术应用的管理规范、标准，中医医疗、保健等人员的执业资格标准、服务规范；参与拟订地方基本药物目录的有关工作；指导和组织实施农村卫生、社区卫生服务中的中医药工作；指导其他医疗机构的中医业务。
联系电话：020-83848486
科技教育处
拟订和组织实施中医药科学研究、技术开发规划，指导中医药科研条件和科技能力建设，组织实施中医药重点科研项目，促进中医药科技成果的转化、应用和推广；承办中医药师承教育、毕业后教育、继续教育和相关人才培训的组织和指导工作；参与拟订各类中医药教育发展规划的有关工作，参与指导中医药教育教学改革；开展与港澳台地区及其他国家和地区中医药方面的交流与合作。
联系电话：020-83848486
